呼吸科目前包括11个分组，分别为慢性阻塞性肺疾病组、睡眠呼吸障碍组、间质性肺病组、肺癌中心、肺栓塞与肺血管疾病组、哮喘组、危重症医学组、感染组、介入组、呼吸治疗组和控烟组。呼吸科目前在职医生共有33人，包括主任医师10人，副主任医师10人和主治医师13人。徐教授领导的多科协助诊治的间质性肺病组，王教授和张教授领导的多科协助的肺癌诊治中心、肖教授领导的呼吸睡眠中心，以及红教授和峰教授领导的肺血管疾病组具有完整的团队构成，也是科室目前的特色。
